Abstract: Connaitre et appréhender les mécanismes de la diversification des espèces est important pour la gestion des écosystèmes, la prévision des impacts des changements climatiques et la compréhension de la biodiversité actuelle et passée. Le but de cette thèse est de comprendre et de déceler les mécanismes génétiques à l’origine de la diversification des espèces en présence de flux de gènes. Cette thèse se focalise sur le modèle biologique Symphonia globulifera, qui compte deux écotypes : le S.globulifera spécialiste de la terra firme et le S.sp1, spécialiste des bas-fonds. Ces deux écotypes montrent une faible différenciation génétique, malgré la présence de deux phénotypes différents. Une première étape a été de mettre en évidence la présence d’une adaptation locale au sein de cette espèce, par le biais d’une expérimentation de jardins de transplantation réciproques, permettant d’expliquer la répartition des écotypes dans leur habitat naturel. Ensuite, dans le but d’identifier les mécanismes sous-jacent à cette adaptation locale, j’ai testé l’hypothèse que la méthylation des gènes pourrait être une marque de l’épigénétique contribuant à la divergence des écotypes, par l’utilisation d’enzyme sensibles à la méthylation dans un protocole de génotypage AFLP. Enfin, un séquençage haut-débit du transcriptome des écotypes en jardins de transplantation réciproques m’a permis de mettre en évidence une expression différentielle des gènes entre les écotypes, qui pourrait expliquer les différences phénotypiques observées entre les écotypes malgré une faible différentiation génétique. Ces travaux de thèse s’appuie, ainsi, sur des données de traits phénotypiques, de génotypage AFLP et de séquençage à haut débit du transcriptome pour montrer la valeur importante de la régulation des gènes dans la divergence des écotypes adaptés localement, et un faible rôle de la méthylation de l’ADN dans l’établissement cette adaptation locale.

Abstract: Formes, couleurs, odeurs… les mécanismes par lesquels les Aracées
attirent les pollinisateurs se sont tellement diversifiés qu’elles sont
devenues de passionnants “cas d’école” pour les évolutionnistes. Ils
commencent aujourd’hui à retracer cette histoire évolutive complexe où
les interactions avec les insectes ne se font pas toujours “au bénéfice de
tous”.

Abstract: Psidium acutangulum Mart. ex DC is used exclusively by the Wayana Amerindians in French Guiana, more particularly for the treatment of malaria. To understand this specific use, we embarked upon evaluating the antimalarial and anti-inflammatory activities of this traditional remedy as prepared by the Amerindian users. The decoction exerted good antiplasmodial activity in vitro (IC50 4 µg/ml on P. falciparum FcB1) and in vivo (39.7% inhibition of P. berghei NK65 in the murine model at 2 × 150 µl/day), as well as a strong anti-inflammatory effect in vitro regarding IL-1β, IL-6 and IL-8. Fractionation of the ethyl acetate extract (IC50 < 1 µg/ml) led to the isolation of six pure compounds, two of them, guaijaverine and the new compound wayanine, being moderately active against P. falciparum FcB1 in vitro (IC50 5 – 7 µg/ml). Along with the absence of cytotoxicity of the decoction and pure compounds, these results support the traditional use of this plant.