Leroy, C., Orivel, J., Dejean, A., & Corbara, B. (2017). Des arbres et des fourmis : échanges de bons procédés. Espèces, (25), 14–23.
Abstract: Sous les tropiques, plantes et fourmis sont impliquées dans nombre d’interactions plus ou moins étroites. Au coeur de réseaux d’interactions impliquant bien d’autres espèces, en échange de protection et de quelques nutriments, des “plantes à fourmis” procurent, dans une relation mutualiste, gite et couvert à des “fourmis à plantes”.
Keywords: Phylogénétique ; Archéozoologie ; Entomologie ; Ecologie ; Microbiologie ; Exobiologie ; Ophiologie
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Milner, N., Potter, E., Roche, W., Tysklind, N., Davidson, I., King, J., et al. (2017). Variation in sea trout (Salmon trutta) abundance and life histories in the Irish Sea. In Sea trout Science and Management (pp. 96–128). Greame Harris.
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Marcon, E. (2016). Mesurer la Biodiversité et la Structuration Spatiale. Habilitation thesis, Université de Guyane, Kourou - Guyane française.
Abstract: Mes travaux de recherche portent sur la caractérisation de l’hétérogénéité, précisément des structures spatiales et de la diversité. J’ai développé de nouvelles mesures de la structure spatiale appliquées principalement en économie géographique et des mesures de diversité appliquées principalement à la biodiversité des arbres. Le fil directeur de ces travaux méthodologiques est de construire des mesures correspondant à une réalité physique, facilement compréhensible, pouvant être utilisées ensuite pour comprendre sans ambiguïté les processus économiques ou écologiques concernés.
Mon projet de recherche à moyen terme consiste à combiner les deux approches pour caractériser la diversité explicitement dans l’espace et dans le temps, et à étendre mes méthodes à d’autres objets (diversité microbienne par exemple) plus complexes. Au-delà de ces travaux méthodologiques, mon objectif à plus long terme est d’aller vers la modélisation des processus générant les patrons de diversité.
Keywords: Statisitques spatiales; Processus ponctuels; Biodiversité;Entropie
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Zoogones, L.: O., Benjamin, & Dourdain, A.: H., Bruno. (2016). Secteur UTCF : Utilisation des terres, leurs changements et la forêt. Cayenne: Vuyane Energie Climat.
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Allié, E. (2016). Assemblage des communautés d'arbres à une échelle locale en forêt tropicale – Apport d'une approche intégrative. Ph.D. thesis, Université de la Guyane, Cayenne - Guyane française.
Abstract: L’objectif de cette thèse est d’étudier les processus d’assemblage responsables de la structuration spatiale des communautés d’arbres à une échelle locale en forêt tropicale et plus particulièrement en Guyane française. L’utilisation de patrons spatiaux est répandue afin d’inférer les processus d’assemblage. L’hypothèse sous-jacente est que les patrons gardent une empreinte spatiale des différents processus. Cependant le lien patron-processus est controversé principalement car (i) différents processus peuvent conduire à des patrons similaires et (ii) la causalité n’est pas évidente du fait que de multiples processus interagissent dans l’espace et le temps et qu’ils peuvent avoir des signatures spatiales antagonistes ou confondues, pouvant masquer les effets de chacun sur le patron final étudié. C’est dans ce contexte que nous proposons une approche intégrative afin d’améliorer l’inférence des processus d’assemblage. Cette approche consiste dans un premier temps à étudier les distributions d’abondance et de performance des arbres dans une analyse espèce par espèce, afin de caractériser la distribution des espèces par rapport à leur niche. Cette approche consiste ensuite à tester l’implication des processus d’assemblage à partir de patrons de diversité au niveau de la communauté entière (i) en considérant les trois facettes de la diversité, (ii) à différentes échelles spatiales et (iii) en tenant compte de l’hétérogénéité environnementale qui structure une majorité d’espèces. L’étude de la distribution d’abondance face à l’altitude relative par rapport au cours d’eau le plus proche a permis de mettre en évidence une forte association d’habitat le long de ce gradient, pour la majorité des espèces communes. Comme le gradient d’altitude relative représente un proxy de l'hydrologie et de la fertilité des sols, la distribution contrastée des espèces le long de ce gradient altitudinal suggère l'importance du filtrage environnemental quant aux propriétés hydrologiques et chimiques des sols. Cependant, cette distribution d’abondance contrastée le long du gradient altitudinal ne concorde ni avec une distribution différentielle de performance face au même gradient ; ni avec une analyse significative des patrons de diversité fonctionnelle face à ce même gradient. L’importance du filtrage environnemental, face aux propriétés hydrologiques et chimiques des sols, est alors remise en cause. Enfin, nos résultats suggèrent que les distributions d’espèces puissent être influencées par la dynamique forestière en lien avec les chutes d’arbres et donc avec la disponibilité en lumière. Cette hypothèse est cohérente avec l’observation d’une forte association d’habitat le long du gradient d’altitude relative puisqu’il y a une plus forte fréquence de chute d’arbres dans les bas-fonds par rapport aux plateaux. De plus, l’importance de la limitation de dispersion mise en évidence sur ce site pourrait renforcer de tels patrons. Bien que l’on ait développé l’approche intégrative afin d’améliorer l’inférence des processus et qu’on l’ait validée via des patrons de diversité simulés, l’inférence n’est pas toujours évidente face à la complexité des écosystèmes étudiés.
Keywords: analyses de patrons spatiaux de points ; association d’habitat ; écologie des communautés ; forêts tropicales humides, Guyane française, patrons de diversité, processus d’assemblage, traits fonctionnels
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Salas-Lopez, A. (2016). Effets de l'anthropisation sur la diversité fonctionnelle des fourmis et leur participation dans des processus écosystèmiques. Ph.D. thesis, Université de la Guyane, Cayenne - Guyane française.
Abstract: Les perturbations d’origine anthropique sont à l’origine de l’érosion de la biodiversité avec des conséquences sur la structure des communautés et pour le fonctionnement des écosystèmes. La vitesse de ces changements a stimulé de nombreuses recherches portant sur les effets de ces modifications sur la biodiversité des organismes et leurs propriétés fonctionnelles. En effet il a été montré que les traits des espèces sont plus importants que leur identité elle-même pour tenir compte de leurs rôles écologiques. Même si la majorité de ces travaux ont étudié la réponse des producteurs primaires sur les écosystèmes terrestres, la contribution d’autres organismes est toutefois essentielle pour maintenir un fonctionnement et une résilience des écosystèmes corrects. Les fourmis sont des organismes cibles intéressants pour étudier de telles modifications du fait de leur abondance et de leur dominance écologique. En effet elles ont une distribution cosmopolite et participent à de nombreuses fonctions dans l’écosystème terrestre. Elles sont également faciles à étudier et des méthodes d’échantillonnage standard existent. Bien que de nombreuses recherches aient démontré des modifications dans la composition spécifique des fourmis dans des gradients environnementaux, un nombre réduit d’entre elles ont étudié la contribution de ces organismes sur le fonctionnement des écosystèmes. De plus, les traits responsables de la stabilité des communautés de fourmis en réponse à ces modifications sont encore peu connus. Il est donc nécessaire de développer une méthodologie capable d‘identifier la participation des fourmis dans des processus écosystémiques permettant également de quantifier leur activité afin de comprendre comment ces organismes agissent sur les capacités de résistance et résilience des écosystèmes. Ainsi, cette thèse vise mettre en lumière i) en quoi la simplification des habitats liée aux activités humaines a des répercussions sur les communautés de fourmis, ii) quels sont les traits responsables du succès écologique d’une espèce ou de son déclin au sein d’un environnement donné, et iii) comment ces variations en composition spécifique impactent l’intensité de participation des fourmis aux processus écosystémiques
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Talaga, S. (2016). Ecologie, diversité e évolution des moustiques (Diptera: Culicidae) de Guyane française : implication dans l'invasion biologique du moustique Aedes aegypti (L.)). Ph.D. thesis, Université de la Guyane, Cayenne - Guyane française.
Abstract: L’Humanité est en train de transformer les paysages de la Terre à une échelle et à des taux encore inégalés. Les invasions biologiques sont l’une des conséquences de ces perturbations anthropiques et engagent souvent des enjeux socio-économiques importants. Ces invasions peuvent également modifier la structure et le fonctionnement des écosystèmes investis, conduisant parfois à des bouleversements écologiques. Le moustique Aedes (Stegomyia) aegypti (Linnaeus 1762) a été introduit dans les Amériques depuis le continent africain il y a environ 400 ans. Actuellement, cette espèce est la principale responsable des épidémies de dengue et de chikungunya dans la zone pantropicale et sa large répartition a très probablement joué un rôle important dans l’expansion récente du virus Zika. La biologie d’Ae. (Stg.) aegypti est particulièrement bien connue, ce qui n’est pas le cas de son écologie, en particulier de ses interactions avec les communautés résidentes. En adoptant une démarche pluridisciplinaire je me suis intéressé à la
contribution relative des facteurs biotiques et abiotiques ainsi que de certains processus évolutifs dans la distribution de cette espèce à différentes échelles en Guyane française. Dans un premier temps j’ai participé à la révision des connaissances fondamentales sur la diversité des moustiques de Guyane. En alliant la taxonomie classique et moléculaire, cette étape a permis de découvrir plusieurs nouvelles espèces et de mettre en place des outils adaptés à la gestion de ce type de données, notamment pour une utilisation future. Dans un second temps la structuration spatio-temporelle des communautés résidentes de
macro-invertébrés aquatiques a été étudiée en milieu urbain. Cela a permis de mettre en évidence l’existence d’interactions antagonistes et mutualistes avec les taxons des communautés résidentes. En particulier, le moustique autochtone Limatus durhamii Theobald 1901 semble empêcher l’établissement durable d’Ae. (Stg.) aegypti dans les milieux faiblement urbanisés via un mécanisme d’exclusion compétitive. Cependant, il apparaît que les interactions avec les communautés résidentes demeurent relativement limitées dans l’espace et dans le temps. À travers l’étude de la spécialisation d’hôtes chez les moustiques associés aux phytotelmes, cette étude suggère que l’histoire évolutive des espèces autochtones pourrait fortement influencer la diversité et la composition des communautés urbaines actuellement en place.
Keywords: Amazonie, Biodiversité, Broméliacée à réservoirs, Culicidae, Invasion biologique, Interaction trophique, Moustiques, Phytotelmes, Spécialisation, Urbanisation, Vecteur
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Leponce, M., Novotny, V., Pascal, O., Robillard, T., Legendre, F., Villemant, C., et al. (2016). Land module of our planet reviewed – Papua New Guinea: aims, methods and first taxonomical results. In Insects of Mount Wilhelm, Papua New Guinea (pp. 11–48). Paris - France: Muséum national d'Histoire naturelle.
Abstract: Until now the altitudinal factor has not been taken into account to estimate tropical arthropod diversity. The ultimate aim of the terrestrial biodiversity
survey “Our Planet Reviewed – Papua New Guinea” was to estimate biological diversity generated by altitudinal turnover of arthropod species. It took place on Mount Wilhelm, Papua New Guinea highest peak (4509 m a.s.l.), and one of the few equatorial mountains outside the Andes left with a continuous undisturbed forest from the sea level all the way to the timber line limit. An unprecedented sampling effort was concentrated over 16 days in 2012 with a semi-simultaneous sampling at eight different elevations (every 500 m from 200 m to 3700 m a.s.l.). Arthropods were collected with various methods: flight interception traps (targeting Coleoptera), Malaise traps (targeting Hymenoptera, Diptera and Hemiptera), Steiner traps (targeting tephritid flies), beating of the understorey vegetation, and insecticide spraying on tree barks (various groups targeted). A botany survey was conducted at each elevation to characterize vegetation. An additional site, Wanang, was sampled according to the same protocol, as replicated lowland site. Our team combined international experts with local postgraduate students, para-ecologists and villagers. Arthropod samples collected during the biotic survey were pre-sorted in Papua New Guinea and forwarded to taxonomists worldwide. The current book presents the first taxonomic results of the biotic survey. Project outputs included not only species discovery, but also direct financial benefits to landowner communities, raised profile of conservation areas, training of paraecologists and postgraduate students, education programmes and, finally, crucial biodiversity information needed for ecological analyses and conservation management.
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Say Anouhe, J. B., Adima, A. A., Niamké, B. F., Stien, D., Kassi Amian, B., Virieux, D., et al. (2016). Wood Natural durability study source of biomolecules: case of Dicorynia guianensis Amsh. Heartwood. In IRG/WP.
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Houël, E., Rodrigues, A. M. S., Jahn-Oyac, A., Bessière, J. - M., Odonne, G., Gonzales, G., et al. (2016). How can plant defences lead to valuable products? Inspiration from plant complexity in phytochemistry. Planta Medica, 81(S01), S1–S381.
Abstract: If plants are known for centuries as a valuable source of molecules, complexity remains and can open up numerous perspectives. Plants have indeed evolved a wide range of secondary metabolites as defense, competition or attraction compounds [1]. More particularly, the exceptional biodiversity encountered in the tropics, along with the presence of various pathogens and a strong herbivory especially linked to a rich entomofauna, leads to a promising chemodiversity, due to the constant and dynamic interactions between plants and their environment. Taking into account the role and “raison d'être”[2] of natural products, and the fact that all these molecules work together as complex mixtures can therefore lead to a new point of view, by shifting from the “magic bullet” classical approach to a “herbal shotgun” strategy[3]. We will illustrate the fact that, inspired by their ecological functions, and taking into account synergistic interactions, some therapeutic applications can be found for these versatile mixtures of compounds. In particular we examined whether the antidermatophytic activity of essential oils (EOs) obtained from particularly fragrant plant species from French Guiana could be used as an indicator for the discovery of active natural products against Leishmania amazonensis. A significant correlation was observed between antidermatophytic and antileishmanial activity, confirming the “alternative use” strategy in the case of EOs, and allowed us to highlight P. hispidum Sw. (Piperaceae) EO as a promising antileishmanial product [4]. We also illustrated the importance of synergistic effects through the example of the antifungal EO of Otacanthus azureus (Linden) Ronse (Plantaginaceae) [5] and the biomimetic design of optimized synergistic mixtures thanks to a full factorial experiment approach.
Keywords: Essential oils ; therapeutic switching ; antifungal agents ; antiparasitic agents ; biomimetic design
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