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Pernes, M., Clair, B., & Beaugrand, J. (2013). Acquisition d'isothermes de sorption d'eau : méthodologie, représentation et application au bois. Le cahier techniques de l'Inra, 80(3), 9.
Abstract: La réalisation d’isothermes de sorption d’eau à l’aide d’une microbalance de sorption de haute précision nécessite préalablement une mise au point méthodologique approfondie. Celle-ci doit prendre en compte à la fois les contraintes techniques de l’appareil, le type d’échantillon étudié ainsi que la problématique scientifique associée. Cette technique, très sensible, associée à une méthodologie spécifique a été appliquée à des échantillons de bois « vert ». La précision de la microbalance de sorption avec une humidité relative pouvant varier de 0 à 95 % permet d’observer des comportements d’hydratation des polymères constitutifs de la paroi végétale. Une représentation des données recueillies dite « chronologique » permet d’appréhender un phénomène naturel irréversible, rencontré lors du séchage du bois. Une représentation plus classique permet de montrer clairement un comportement d’hystérésis en rapport avec l’état d’hydratation des fibres végétales et notamment leur histoire thermo-hydrique.
Keywords: sorption d’eau ; microbalance ; isotherme ; précision ; fibres ; bois
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Richard-Hansen, C., & Hansen, E. (2015). 50 ans d'évolution de la gestion de la faune en Guyane – Mammifères. In Nature guyanaise – 50 ans de progrès et de souvenirs (pp. 211–217). Cayenne - Guyane française: Editions Orphie.
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Rejou Mechain, M., Tanguy, A., Piponiot, C., Chave, J., & Herault, B. (2017). Package 'BIOMASS' : Estimating aboveground biomass and its uncertainty in tropical forests.
Abstract: Contains functions to estimate aboveground biomass/carbon and its uncertainty in tropical forests. These functions allow to (1) retrieve and to correct taxonomy, (2) estimate wood density and its uncertainty, (3) construct height-diameter models, (4) estimate the aboveground biomass/carbon at the stand level with associated uncertainty. To cite BIOMASS, please use citation(``BIOMASS'').
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Stien, D., Rodrigues, A. M. S., Makerri, C., Odonne, G., & Eparvier, V. (2014). Experimental design optimization of antimicrobial mixtures of active VOCs. Planta Medica, 80(16), P1M3.
Abstract: In this beginning of the 21st century, a child dies from malaria every minute in Sub-Saharan Africa and tuberculosis kills every 20 seconds [1]. Also, the hidden burden of chronic viral infections such as HIV and hepatitis B and C is sobering, affecting at least 1 in 20 people globally. In fact, many authors believe that humanity is on the verge of a post-antibiotic era [2]. We believe that something different has to be brought into the scientific debate around anti-infective agents. Our opinion is that natural synergistic mixtures, which have been protecting plants for ages, can inspire the discovery of synergistic pharmaceutical preparations. As a first model approach, a set of 66 essential oils has been analysed by GC-MS and tested (Minimal Inhibitory Concentration, MIC) against pathogenic yeasts Candida albicans and C. parapsilosis. A comparative holistic analysis of the dataset allowed us to identify 6 candidate anticandidal agents: Z-ligustilide, eugenol, eugenyl acetate, citral (mixture of geranial and neral), thymol, and β-citronellol. These compounds were combined following a full factorial experimental design approach in order to optimize the anticandidal selectivity index (SI = IC50 (MRC5 cells)/MIC) of the reconstituted mixtures. It was found that Z-ligustilide and eugenol are the two main factors that most contribute to the increase of the SI, while significantly positive interaction effect was recorded for these two compounds (Fig. 1). A positive interaction effect was also detected between citral and both Z-ligustilide and eugenol. These 3 plant defence compounds can therefore be used to construct anticandidal mixtures.
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Tinaut, A. (2015). Génétique écologique et génomique des évènements de divergence chez les complexes d'espèces en forêt tropicale humide. Ph.D. thesis, Université de Guyane, Cayenne - Guyane française.
Abstract: Connaitre et appréhender les mécanismes de la diversification des espèces est important pour la gestion des écosystèmes, la prévision des impacts des changements climatiques et la compréhension de la biodiversité actuelle et passée. Le but de cette thèse est de comprendre et de déceler les mécanismes génétiques à l’origine de la diversification des espèces en présence de flux de gènes. Cette thèse se focalise sur le modèle biologique Symphonia globulifera, qui compte deux écotypes : le S.globulifera spécialiste de la terra firme et le S.sp1, spécialiste des bas-fonds. Ces deux écotypes montrent une faible différenciation génétique, malgré la présence de deux phénotypes différents. Une première étape a été de mettre en évidence la présence d’une adaptation locale au sein de cette espèce, par le biais d’une expérimentation de jardins de transplantation réciproques, permettant d’expliquer la répartition des écotypes dans leur habitat naturel. Ensuite, dans le but d’identifier les mécanismes sous-jacent à cette adaptation locale, j’ai testé l’hypothèse que la méthylation des gènes pourrait être une marque de l’épigénétique contribuant à la divergence des écotypes, par l’utilisation d’enzyme sensibles à la méthylation dans un protocole de génotypage AFLP. Enfin, un séquençage haut-débit du transcriptome des écotypes en jardins de transplantation réciproques m’a permis de mettre en évidence une expression différentielle des gènes entre les écotypes, qui pourrait expliquer les différences phénotypiques observées entre les écotypes malgré une faible différentiation génétique. Ces travaux de thèse s’appuie, ainsi, sur des données de traits phénotypiques, de génotypage AFLP et de séquençage à haut débit du transcriptome pour montrer la valeur importante de la régulation des gènes dans la divergence des écotypes adaptés localement, et un faible rôle de la méthylation de l’ADN dans l’établissement cette adaptation locale.
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Gérard, J., Guidal, D., Paradis, S., Cerre, J. C., Châlon, I., Thévenon, M. F., et al. (2016). Atlas des bois tropicaux. Quae.
Keywords: bois ; nomenclature ; identification ; anatomie du bois ; technologie du bois ; propriété technologique ; propriété physicochimique ; propriété mécanique ; utilisation ; préservation du bois ; sciage ; séchage ; monde ; bois tropical ; atlas ; fiche technique ; choix des bois
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Petit, M. (2011). Approche ontogénique des stratégies de développement et d'acquisition des minéraux chez une broméliacée épiphyte à réservoir. Master's thesis, AgroParisTech, Kourou - Guyane française.
Abstract: Les épiphytes, de par les contraintes physiologiques de leur milieu de vie, ont développés des stratégies d’acquisition de l’eau et des minéraux des plus originales. Les broméliacées à réservoirs abritent un réseau trophique aquatique approvisionnant la plante en minéraux. Aechmea mertensii est une broméliacée à réservoirs se développant exclusivement dans les jardins de fourmis initiés en Guyane française par deux espèces de fourmis, Camponotus femoratus et Pachycondyla goeldii. L’objectif de cette étude a été d’étudier l’influence de la fourmi associée sur le développement ontogénique d’A. mertensii et sur les caractéristiques des communautés aquatiques dans le but de déterminer les stratégies d’acquisition des minéraux. Par les mesures d’un ensemble de traits foliaires, nous avons montré qu’A.mertensii présente un développement homoblastique alors que dans la littérature les broméliacées à réservoirs sont décrites pour avoir un développement hétéroblastique. Aussi, l’identité de la fourmi influe sur le phénotype d’A. mertensii et sur les communautés aquatiques et ceci dès les plus jeunes stades de développement. Les plantes associées à P. goeldii montrent, pour un nombre de réservoirs donné, un développement morpho-anatomique et biochimique plus élevé par rapport à celles associées à C. femoratus. Nous avons révélé, par
des dosages de !13C, que le fonctionnement photosynthétique des plantules divergeait des plantes avec des réservoirs. Finalement, cette étude révèle qu’A. mertensii aurait deux stratégies principales d’acquisitions des minéraux (foliaire ou racinaire) fortement liées à la présence de divers organismes mutualistes.
Keywords: Mutualisme ; Ontogénèse ; Broméliacée à réservoirs ; Epiphyte ; Stratégies d'acquisition des minéraux ; Jardins de fourmis ; Phytotelme
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Guerrere, V. (2011). Les variables environnementales et la répartition spatiale de l'AGB, une approche locale pour une vision régionale en Guyane française. Master's thesis, AgroParisTech, Kourou - Guyane française.
Abstract: Dans un objectif de recherche des déterminants de la spatialisation des services rendus par les écosystèmes forestiers, les questions de définition des unités paysagères de référence et les changements d’échelles sont primordiaux. Nous avons opéré dans la continuité du travail fourni récemment en Guyane par la carte des habitats (Guitet, à paraître), définition qui part du postulat qu’une typologie géomorphologique, donc une approche paysagère, permet de définir des conditions homogènes représentatives d’un habitat (composition floristique, structure…). C’est ainsi que 6 grandes formations géomorphologiques regroupent 12 unités paysagères, constituées de 84 unités de reliefs. Nous avons profité des inventaires du site de Counami (411 placettes de 0.3 ha sur 12 240 ha) comme cas d’étude, nous plaçant ainsi sur une unité de relief particulière représentative d’un habitat spécifique. Cet inventaire systématique à fort taux de sondage, est un cadre idéal pour tenter d’expliquer les structures forestières en fonction des conditions environnementales. Ainsi chaque parcelle a été caractérisée, lors de sa création dans les années 1999, par un certain nombre de descripteurs écologiques semi-quantitatifs, auxquelles nous avons ajouté des variables issues du SIG et de la télédétection. L'objectif de la présente étude est de définir les variables environnementales qui permettent d’expliquer la variabilité spatiale de la biomasse à l’échelle d’un massif. Un fort gradient de biomasse se dessine le long de la toposéquence du massif de Counami. De la même sorte, de nombreuses variables
semblent liées à cette topographie, nous incitant ainsi à définir des stations forestières caractérisées par la position topographique, amenant à une autre segmentation du territoire à une échelle plus fine. Les variables qui expliquent en partie la spatialisation des niveaux de biomasse sont principalement : la position topographique et les pentes, la carte des chablis, l’hydromorphie apparente pour les bas-reliefs et l’hydromorphie sous-terraine pour les reliefs, l’encaissement localisé, les grandes formations forestières, l’indice SIWSI (Short Infrared Water Stress Index) et l’indice EVI (MODIS-Enhanced Vegetation Index). D’autres indices pressentis comme intéressants, ont eu des résultats décevants : carte des zones inondables, HAND (MODIS-Height Above Nearest Drainage). Les objectifs à plus longs termes sont de tester ces variables, et d’en intégrer d’autres (conditions climatiques par exemple) pour comprendre la variabilité spatiale de la biomasse dans les autres unités de reliefs et unités paysagères afin d’aboutir à une carte de la biomasse à l'échelle de la Guyane.
Keywords: Carbone, biomasse, AGB, modélisation, topographie, géomorphologie, Guyane, hydromorphie, géologie, physiographie, phénologie, MODIS, SIG, SAGA, SRTM, EVI, SIWSI, NDVI
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Kozon, I. (2014). Ecologie et conservation de Cyrtopodium cristatum – Orchidée emblématique des savanes guyanaises. Master's thesis, AgroParisTech, Kourou - Guyane française.
Abstract: Les savanes littorales guyanaises ne représentent que 0.3 % du département (ONF, 2010). Elles subissent la pression due au développement économique et démographique de la côte guyanaise, et sont de ce fait des éléments menacés, tout comme les espèces qu’elles abritent (Palisse, 2013). Cyrtopodium cristatum est une espèce rare et protégée de la famille des Orchidaceae, présente dans les savanes basses et sèches parcourant le littoral Guyanais. Elle a été découverte pour la première fois en Guyane, dans les savanes de Matiti en 2000. Et depuis 2010, elle a été retrouvée sur des pierriers situés en haut de petites collines, dans le domaine du Centre Spatiale Guyanais. 15 pierriers ont été étudiés, où C. cristatum est présente pour un total de 330 pieds. Ses caractéristiques morphologiques ont été décrites, de l’organe de réserve appelé pseudobulbe aux graines minuscules contenues par millions dans une capsule déhiscente. L’étude de son habitat a été faite par rapport à la topographie et à la flore typique qui l’entoure. Cette espèce d’orchidée est associée à des endomycorhizes racinaires, et à certains insectes (fourmis, abeilles, diptères). La dynamique de son habitat est abordée à travers le problème apparent de l’envahissement des pierriers par deux cypéracées (Trachypogon spicatus et Scleria cyperina). Nous proposons des pistes pour la conservation de cette orchidée et son habitat.
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Aubry Kientz, M. (2014). Quelle sera la réponse des forêts tropicales humides à l'augmentation des températures et aux changements de pluviométrie ? Modéliser la dynamique forestière pour identifier les processus sensibles en Guyane française. Ph.D. thesis, Université Antilles Guyane, Cayenne - Guyane française.
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